עפ"י החשד, השניים הבחינו בראשי הישיבה מסיירים יחד עם בעל נכס מקרקעין לצורך בחינת רכישתו בעיר, ולפיכך דרשו מהם באיומים לעזוב את המקום ותקפו אותם בבעיטות ואגרופים במשך מספר דקות ונמלטו מהמקום.
חוקרי תחנת יפו פתחו בחקירה במסגרתה זיהו תוך פרק זמן קצר את החשודים - שני אחים תושבי יפו בשנות ה-30 לחייהם, ועצרו אותם לחקירה בחשד לתקיפה, בסיומה נכלאו. כאמור, בתום חקירת המשטרה ובחינה של הפרקליטות, הגישה יחידת התביעות של משטרת ישראל במחוז ת"א כתב אישום נגד שני האחים.
המפגינים היהודים נשאו שלטים שעליהם נכתב: "עם ישראל חי", "לא מנצחים אותנו כל כך מהר", ועוד. מנגד, קראו המפגינים הערבים לעברם: "יפו ליפואים", "מתנחלים הביתה" ושרו: "ברוח ודם נפדה את יפו". המשטרה חצצה בין שני המחנות. בשלב מסוים החלו המפגינים הערבים ליידות אבנים ולירות זיקוקים, ולמקום הוזעקו פרשים כדי לפזר את המתפרעים.
