בפעילות משותפת לצה"ל, שירות הביטחון הכללי ומשטרת ישראל נעצר מאהר עודה, בחשד שעמד בראש מפקדת חמאס הצבאית שפעלה ברמאללה במהלך האינתיפאדה השנייה, והיתה אחראית לשורה של פיגועים קטלניים שבהם נרצחו כ-70 ישראלים. בין היתר, היתה התארגנות זו אחראית לפיגוע הקטלני בקפה הלל בירושלים ב-9 בספטמבר 2003, שבו נרצחו שבעה ישראלים, ולפיגוע בצומת צריפין שאירע שש שעות מוקדם יותר ובו נרצחו שמונה חיילים. מעצרו של עודה, שהיה מבוקש בישראל מאז שנות ה-90, הוא השלב האחרון בסיכולה של מפקדת חמאס שפעלה ברמאללה ובהנהגתה היו שותפים גם איברהים חאמד ועבדאללה ברגותי, שנעצרו בעבר, וששמותיהם עולים לא אחת בדרישות חמאס במו"מ לשחרור גלעד שליט. המעצר התאפשר בזכות מידע מודיעיני מדויק שהעביר השב"כ. סמוך לשעה 3 לפנות בוקר בלילה שבין שבת לראשון הגיעו כוחות ימ"מ, בליווי חיילי חטיבת כפיר שהיו במקום, לבית רעייתו וילדיו של המבוקש. עודה שהה באותה עת בקומה האחרונה של הבניין, וכשהבין שאין לו אפשרות להימלט, הסגיר את עצמו ללא התנגדות. עודה, בן 47, נשוי ואב לארבעה, במקור מהכפר עין יברוד מצפון-מזרח לרמאללה, החל את פעילותו בחמאס בראשית שנות ה-90, אז הקים חוליה צבאית בכפרו שחטפה וחקרה חשודים בשיתוף פעולה עם ישראל, וכן דרשה אמצעי לחימה לצורך ביצוע פיגועים. בשנת 1998 נחקר עודה על ידי מנגנוני הביטחון הפלשתיניים וכן היה עצור מספר חודשים בכלא הפלשתיני. "המעצר ממחיש את חופש הפעולה של צה"ל בשטחים, כולל בשטחי A", הבהירו אתמול גורמים צבאיים, "אין התיישנות על מעשיהם של מרצחים, ואנו נמשיך לפעול ברוח זו". בעקבות המעצר האשים חמאס את מנגנוני הבטחון הפלשתיניים במסירת מידע על מקום הימצאו של עודה לשב"כ. ברשות הפלשתינית דחו את הטענות. "למנגנוני הביטחון ברמאללה לא היה ידוע על הפעולה הישראלית", אמרו בכירים במנגנוני הביטחון הפלשתיניים לכלי התקשורת הפלשתיניים, "על חמאס לבדוק ולמצוא מי החפרפרת שפועלת בשורות הארגון".